Eclipseでウェブアプリケーションを作成するには、そのためのプラグインが必要です。
Eclipse IDE for Java EE Developers
をインストールしているのであれば問題ないです。それ以外のを選択した場合には別途プラグインが必要なことがあります。
利用するプラグイン
Web Tools Platformプラグインのインストール（Eclipse IDE for Java EE Developersをインストールしていれば無視して良いです）
Google Plugin for Eclipseのインストール（通常は不要ですが、本講座ではこの利用を前提にします）